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誰(shuí)是微生物中的“巨人”?

中國(guó)科普博覽
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中國(guó)科協(xié)、中科院攜手“互聯(lián)網(wǎng)+科普”平臺(tái),深耕科普內(nèi)容創(chuàng)作
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近日,法國(guó)科學(xué)家從加勒比海紅樹(shù)林灘涂中分離出了一種叫做華麗硫珠菌(巨大嗜硫珠菌)的新型細(xì)菌,它的尺寸達(dá)到了驚人的2厘米,肉眼輕松可見(jiàn)。細(xì)菌長(zhǎng)到跟蠕蟲(chóng)一樣的大小,確實(shí)令人咋舌。

巨大嗜硫珠菌(白色亮線)與硬幣的對(duì)比

(圖片來(lái)源:參考文獻(xiàn)5)

那么,我們?yōu)槭裁磳⑷A麗硫珠菌界定為細(xì)菌?它為什么會(huì)長(zhǎng)到如此巨大的尺寸?其他的微生物中有沒(méi)有這樣的巨無(wú)霸存在?想要回答這些問(wèn)題,我們還得從生物的分類(lèi)以及各種微生物間的聯(lián)系與區(qū)別說(shuō)起。

一、最為主流的生物分類(lèi)方法——三域說(shuō)

生物的分類(lèi)對(duì)人類(lèi)而言是非常重要的科學(xué)問(wèn)題,只有正確分類(lèi)才能更加有效地認(rèn)識(shí)和了解不同生物,從而更好地對(duì)它們加以利用或保護(hù)。目前在生物學(xué)界,比較主流的認(rèn)知是將生物分為細(xì)菌域、古菌域和真核生物域三大類(lèi),這種分類(lèi)方式基于核糖體RNA序列,而非單純依賴(lài)各物種間的解剖學(xué)特征,具有比較高的科學(xué)性。

三域說(shuō)示意圖

(圖片來(lái)源:參考文獻(xiàn)2)

值得一提的是,病毒不屬于上述任何一個(gè)類(lèi)別。這是因?yàn)椴《静痪邆涿撾x細(xì)胞獨(dú)立生存的能力,只有在感染細(xì)胞后才表現(xiàn)出類(lèi)似生命的特征,因此在上述分類(lèi)方式中,病毒往往作為一個(gè)非生物的補(bǔ)充而存在。

三域說(shuō)中細(xì)菌域和古細(xì)菌域的生物間存在一定的相似性,二者均為單細(xì)胞生物,且細(xì)胞種類(lèi)均屬于原核細(xì)胞。但因?yàn)樵诩?xì)胞膜脂質(zhì)和核糖體RNA等方面存在根本性的差異,細(xì)菌和古細(xì)菌被分成了兩個(gè)域,事實(shí)上它們的祖先從大約27億年前就開(kāi)始了相互獨(dú)立的演化,可以說(shuō)是完全不同的兩種生物。

需要注意的是,古細(xì)菌的名稱(chēng)中雖然帶有“古”這個(gè)說(shuō)法,但從進(jìn)化角度來(lái)說(shuō),古細(xì)菌并非是“古代的細(xì)菌”,也并非是現(xiàn)代細(xì)菌的祖先。實(shí)際上,古細(xì)菌在進(jìn)化上更加接近于真核生物,甚至被廣泛地認(rèn)為是真核生物的祖先。

真核細(xì)胞和原核細(xì)胞示意圖

(圖片來(lái)源:維基百科)

真核生物中雖然也有結(jié)構(gòu)非常簡(jiǎn)單的單細(xì)胞生物,但本質(zhì)上來(lái)說(shuō)它們的細(xì)胞都是真核細(xì)胞,和原核細(xì)胞相比,存在結(jié)構(gòu)上的根本區(qū)別。真核細(xì)胞內(nèi)含有細(xì)胞核,因此獲得了真核這一名稱(chēng)。真核細(xì)胞中還含有其它細(xì)胞器,如線粒體、葉綠體、高爾基體等。相對(duì)于真核細(xì)胞,原核細(xì)胞一般沒(méi)有細(xì)胞內(nèi)膜、沒(méi)有核膜包裹的成型細(xì)胞核,細(xì)胞內(nèi)無(wú)染色體,DNA鏈未螺旋化,并以游離的形式存在于細(xì)胞質(zhì)中,細(xì)胞質(zhì)內(nèi)也無(wú)任何有膜的細(xì)胞器(如線粒體或葉綠體)。

總而言之,真核細(xì)胞比原核細(xì)胞的結(jié)構(gòu)復(fù)雜許多,我們?nèi)粘I钪兴?jiàn)的各種動(dòng)植物(當(dāng)然也包括人類(lèi)自身)均由真核細(xì)胞構(gòu)成,屬于真核生物。

豐富多彩的真核生物

(圖片來(lái)源:維基百科)

二、微生物巨無(wú)霸評(píng)選,參賽資格很重要

說(shuō)完了生物的分類(lèi),我們?cè)賮?lái)看看微生物應(yīng)當(dāng)如何分類(lèi)。微生物是難以用肉眼直接看到的微小生物總稱(chēng),它們的分類(lèi)其實(shí)并沒(méi)有公認(rèn)的說(shuō)法,也沒(méi)有足夠嚴(yán)謹(jǐn)?shù)纳飳W(xué)依據(jù)。

目前,生物學(xué)界傾向于將微生物分為如下六種,它們分別是藻類(lèi)、原生動(dòng)物、菌類(lèi)(真菌)、細(xì)菌、古細(xì)菌以及病毒。這六種微生物中的前面三種屬于真核生物域,細(xì)菌和古細(xì)菌各成一域,病毒則屬于非生物。不過(guò),對(duì)于我們這些普通人而言,誰(shuí)都領(lǐng)教過(guò)病毒厲害,在我們的日常認(rèn)知中,也早就把病毒作為微生物的代表了。

必須指出的是,在藻類(lèi)、原生動(dòng)物、菌類(lèi)(真菌)三種真核生物中,雖然不少成員都是不借助顯微鏡就無(wú)法看清的微小生物,但也有很多“巨人”存在。例如真菌中的代表——蘑菇,就很容易長(zhǎng)到驚人的體型。例如,我國(guó)科學(xué)家曾經(jīng)在2018年發(fā)現(xiàn)過(guò)一株號(hào)稱(chēng)地球上最大真菌的蘑菇,它的長(zhǎng)度達(dá)到了12米之巨。

然而,現(xiàn)有的文獻(xiàn)中曾報(bào)道過(guò),1998年美國(guó)林業(yè)局的科學(xué)家們?cè)诙砝諏莅l(fā)現(xiàn)了一株奧氏蜜環(huán)菌(Armillaria ostoyae)。通過(guò)不同位置的DNA測(cè)定結(jié)果,這株真菌的個(gè)體占地890公頃,可能已在森林中生長(zhǎng)了約2400年。

也許有人會(huì)說(shuō),蘑菇是多細(xì)胞真菌,長(zhǎng)到很大并不稀奇。這話沒(méi)錯(cuò),但很多單細(xì)胞藻類(lèi)和單細(xì)胞原生動(dòng)物也能長(zhǎng)到完全不好意思說(shuō)自己是微生物的程度。比如高中生物課本上提到過(guò)的傘藻,就是一種單細(xì)胞藻類(lèi),它的細(xì)胞核位于基部,周?chē)屑俑?,向上伸出“帽”和“柄”等結(jié)構(gòu)。傘藻的尺寸其實(shí)就有2到5厘米之巨,已經(jīng)跟微生物不沾邊了。而更加夸張的一些單細(xì)胞藻類(lèi)和單細(xì)胞原生動(dòng)物,可以達(dá)到數(shù)十厘米甚至數(shù)米長(zhǎng)。

幾種巨大的單細(xì)胞生物,左起分別是球法囊藻、衫葉蕨藻、傘藻

(圖片來(lái)源:維基百科)

當(dāng)然,一般這樣巨大的單細(xì)胞物種,其實(shí)細(xì)胞內(nèi)部并不止有一個(gè)細(xì)胞核,而是多個(gè)細(xì)胞核間形成一種所謂的“合胞體”形態(tài)。之所以說(shuō)它們是單細(xì)胞物種,是因?yàn)榻M成它們身體的結(jié)構(gòu)內(nèi)部,確實(shí)沒(méi)有細(xì)胞壁或者細(xì)胞膜一類(lèi)分離開(kāi)不同細(xì)胞的結(jié)構(gòu)。

如此說(shuō)來(lái),真正的微生物巨無(wú)霸也就只能在細(xì)菌、古細(xì)菌和病毒中進(jìn)行選拔了。

三、顛覆認(rèn)知的微生物巨人們

先來(lái)看細(xì)菌,在本次的超級(jí)巨型細(xì)菌被發(fā)現(xiàn)之前,世界上最大的細(xì)菌(體積)一直由納米比亞嗜硫珠菌保持。1999年,這種細(xì)菌被發(fā)現(xiàn)于納米比亞大陸架的海洋沉淀物中。它的平均直徑為0.1到0.3 毫米,最大的個(gè)體甚至達(dá)到接近1毫米,大到可用肉眼觀察。而我們非常熟悉的大腸桿菌,長(zhǎng)度不過(guò)是幾個(gè)微米,兩者體積相差上千倍。

本次發(fā)現(xiàn)的巨大嗜硫珠菌,直接將之前的記錄刷新了數(shù)千倍,它們的長(zhǎng)度可以達(dá)到夸張的2厘米。不僅肉眼可見(jiàn),更能用鑷子輕松夾起,形態(tài)上和人類(lèi)睫毛差不多。假如用成人的身高來(lái)類(lèi)比普通細(xì)菌的大小,巨大嗜硫珠菌的高度就是珠穆朗瑪峰,是普通細(xì)菌的5000倍以上。

巨大嗜硫珠菌(A/B)與大腸桿菌的尺寸對(duì)比 (圖片來(lái)源:參考文獻(xiàn)1)

與普通細(xì)菌相比,巨大嗜硫珠菌的DNA尺寸更大,遺傳信息數(shù)量大約是大腸桿菌3倍。身為原核生物的它并沒(méi)有真核生物一樣的細(xì)胞核結(jié)構(gòu),但在其細(xì)胞內(nèi)部,具有多個(gè)承載著DNA的小型類(lèi)細(xì)胞器。在這些DNA“核心”周?chē)?,蛋白質(zhì)大量合成,從而成長(zhǎng)為巨大的尺寸。它的發(fā)現(xiàn)者們最初壓根兒沒(méi)想過(guò)這是一種細(xì)菌,但經(jīng)過(guò)DNA檢測(cè),證實(shí)了這種龐然大物確實(shí)是獨(dú)立個(gè)體。

古細(xì)菌大部分是生活在極端環(huán)境中的嗜極生物,一般人對(duì)它們的了解并不多。目前最大的古細(xì)菌,尺寸大約是十幾個(gè)微米,最大的桿狀古細(xì)菌長(zhǎng)度可以達(dá)到近100微米(0.1毫米)。不過(guò)可能是受到生存環(huán)境的制約,人類(lèi)到目前為止還沒(méi)有發(fā)現(xiàn)堪稱(chēng)“巨大”的古細(xì)菌種類(lèi)。

古細(xì)菌是深海熱泉的常客 (圖片來(lái)源:維基百科)

病毒結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單,缺乏細(xì)胞外獨(dú)立生存能力,也因此被排除在三域說(shuō)之外。結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單當(dāng)然意味著尺寸微小,正是因?yàn)檫@個(gè)原因,病毒的發(fā)現(xiàn)比細(xì)菌晚了數(shù)百年。在電子望遠(yuǎn)鏡發(fā)明后,人類(lèi)才真正觀察到了病毒。以新冠病毒為例,它的尺寸僅有120個(gè)納米,體積上來(lái)說(shuō)是大腸桿菌的幾百分之一。不過(guò)近年來(lái),不少巨型病毒被相繼發(fā)現(xiàn),也大大顛覆了人類(lèi)之前對(duì)于病毒的認(rèn)知。

2003年,法國(guó)科學(xué)家發(fā)現(xiàn)了米米病毒(Mimivirus),其尺寸大約達(dá)到400個(gè)納米,它的發(fā)現(xiàn)也標(biāo)志著巨大病毒開(kāi)始進(jìn)入到人類(lèi)的視野。目前,人類(lèi)發(fā)現(xiàn)的最大病毒是在2014年報(bào)道的闊口罐病毒。這種病毒屬于雙鏈DNA病毒,發(fā)現(xiàn)于西伯利亞凍土冰芯樣品中,最大長(zhǎng)度接近2微米,直徑也達(dá)到0.5微米。外型上來(lái)看非常像古羅馬時(shí)期使用的闊口陶罐,因此得名。解凍后的闊口罐病毒具有感染變形蟲(chóng)并致其死亡的能力,因此除了尺寸具有話題性,人們也對(duì)全球變暖導(dǎo)致永凍土解凍后釋放未知病原體的可能產(chǎn)生了前所未有的擔(dān)憂。

闊口罐病毒和新冠病毒(右)的尺寸對(duì)比

(圖片來(lái)源:維基百科)

從某種角度來(lái)說(shuō),微生物們是地球真正的主人,它們出現(xiàn)在地球的每一個(gè)角落。從熾烈的深海熱液噴口,到冰封千萬(wàn)年的永久凍土,微生物們頑強(qiáng)地生息繁衍,最終在地球能量和物質(zhì)循環(huán)中扮演了關(guān)鍵角色。地球塑造著微生物,微生物又反過(guò)來(lái)塑造地球。它們?cè)谶M(jìn)化上堪稱(chēng)神奇的多樣性,讓人類(lèi)不斷突破對(duì)“生物”這一概念的認(rèn)知?;蛟S,將來(lái)還會(huì)有更加巨大的微生物來(lái)刷新微生物巨無(wú)霸榜單。

參考文獻(xiàn)

A centimeter-long bacterium with DNA contained in metabolically active, membrane-bound organelles

https://www.science.org/doi/10.1126/science.abb3634

第30回 27億年前の「ご先祖様」が體內(nèi)にバクテリアを取り込むまで

https://gendai.ismedia.jp/articles/-/73944

沒(méi)有顯微鏡還想觀察細(xì)胞?這些“巨無(wú)霸”單細(xì)胞生物能滿足你

https://tech.sina.com.cn/roll/2020-01-06/doc-iihnzhha0600724.shtml

世界最大のウイルス「ピソウイルス」の詳細(xì)な構(gòu)造を低溫電子顕微鏡で解析

https://www.nips.ac.jp/release/2017/11/post_352.html

Largest known bacteria in the world are visible to the naked eye

https://www.newscientist.com/article/2325909-largest-known-bacteria-in-the-world-are-visible-to-the-naked-eye/

出品:科普中國(guó)

制作:郭菲(煙臺(tái)大學(xué))

監(jiān)制:中國(guó)科普博覽

評(píng)論
演繹無(wú)限精彩!
大學(xué)士級(jí)
微生物是地球真正的主人,它們?cè)谶M(jìn)化上堪稱(chēng)神奇的多樣性,讓人類(lèi)不斷突破對(duì)“生物”認(rèn)知,將來(lái)還會(huì)刷新微生物巨無(wú)霸榜單。
2022-09-09
大偉????♂?
太師級(jí)
生物的分類(lèi)對(duì)人類(lèi)而言是非常重要的科學(xué)問(wèn)題,只有正確分類(lèi)才能更加有效地認(rèn)識(shí)和了解不同生物,從而更好地對(duì)它們加以利用或保護(hù)。
2022-09-09
上善若水,厚德載物??破胀茝V,知識(shí)共享。
大學(xué)士級(jí)
從某種角度來(lái)說(shuō),微生物們是地球真正的主人,它們出現(xiàn)在地球的每一個(gè)角落。
2022-09-09