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[科普中國(guó)]-堅(jiān)持多年突破難關(guān),中國(guó)科學(xué)家首次發(fā)現(xiàn)藏在病毒中的朊病毒

我是科學(xué)家
原創(chuàng)

作者: Yuki、Nekout

編輯:kamin

“你們做不出來(lái)。”

當(dāng)?shù)弥笱蟊税兜闹袊?guó),有個(gè)名不見(jiàn)經(jīng)傳的小團(tuán)隊(duì)要嘗試鑒定朊病毒,美國(guó)酵母朊病毒鑒定的頂級(jí)專家蘭德?tīng)枴す柗蚵≧andal Halfmann)這樣評(píng)價(jià)。

然而,就在前天,2019年1月21日,這個(gè)團(tuán)隊(duì)的研究成果:《一種病毒編碼的朊病毒》(A viral expression factor behaves as a prion)發(fā)表在《自然-通訊》雜志上 [1] 。

這一研究, 將朊病毒的發(fā)現(xiàn)歷程從動(dòng)物、植物、真菌、細(xì)菌擴(kuò)展到了最后一種生命形式——病毒 。同時(shí),可能為揭示病毒感染和阿爾茲海默癥之間的必然聯(lián)系帶來(lái)新的啟示。

這是中國(guó)第一個(gè)成功在朊病毒鑒定領(lǐng)域開(kāi)拓疆土的團(tuán)隊(duì),它的成員總共只有三人: 許曉東、陳紅英和南昊 。

(這項(xiàng)研究的發(fā)起者,許曉東副教授。圖片來(lái)源:南昊)

蛋白膠上的“異常信號(hào)”

時(shí)間回到2002年,許曉東剛從中科院微生物所來(lái)到英國(guó)雷丁大學(xué),跟隨著名病毒學(xué)教授伊恩·瓊斯(Ian Jones)讀博士。當(dāng)時(shí)他的課題是研究昆蟲(chóng)桿狀病毒中幾種晚期表達(dá)因子。

那時(shí)候,蛋白的研究手段還沒(méi)有現(xiàn)在這么豐富。為了研究這些晚期表達(dá)因子的功能特征,許曉東開(kāi)始嘗試分別在昆蟲(chóng)細(xì)胞和大腸桿菌中,重組表達(dá)這些蛋白。而為了檢測(cè)蛋白表達(dá)蛋白是否成功、表達(dá)蛋白的產(chǎn)量多少,就需要用到一套電泳+免疫印跡檢測(cè)方法。

這個(gè)過(guò)程,就好像是讓細(xì)胞中所有的蛋白進(jìn)行一場(chǎng)“游泳比賽”。由于這些蛋白原本形狀不一、電荷各異,會(huì)影響到比賽結(jié)果。因此需要先加入特殊試劑煮沸樣品,剝奪其形狀,覆蓋其電荷,讓它們變成統(tǒng)一直徑、穿著“等身負(fù)電荷泳裝”的“圓棒”。這樣,它們?cè)谟斡境亍郾0纺z電泳(SDS-PAGE)中的游速,就只和各自體重(分子量大?。┯嘘P(guān)了。

(蛋白質(zhì)樣品在100℃用SDS處理后變?yōu)閹щ姾傻摹皥A棒”)

電泳凝膠的設(shè)計(jì)可謂十分精妙,它分為上下兩層,通電后,上層的濃縮膠會(huì)讓排隊(duì)進(jìn)場(chǎng)的蛋白隊(duì)員們“縱列變橫列”,匯集于泳道前站成一排做好準(zhǔn)備。等進(jìn)入下層的分離膠,就像聽(tīng)到一聲哨響,不同分子量的蛋白開(kāi)始各自發(fā)力向終點(diǎn)(電泳槽正極)游動(dòng)。

質(zhì)量小的蛋白受到的阻力小,游得快;質(zhì)量大的蛋白受到的阻力大,游得慢。“游泳比賽”結(jié)束后,通過(guò)后續(xù)檢測(cè),就可以大致得知某種特定的蛋白含量究竟有多少了。

(蛋白電泳用到的凝膠(示意圖)。 Nekout繪制。)

通常來(lái)講,前期處理蛋白用到的試劑(SDS和巰基乙醇)會(huì)拆開(kāi)所有聚合的蛋白,濃縮膠中是不會(huì)再留有蛋白的。所以,大家 一般都會(huì)直接把它切下來(lái)丟掉 ,只檢測(cè)分離膠的部分。

而彼時(shí),剛到英國(guó)第一次接觸這個(gè)操作的許曉東,對(duì)這套流程顯然尚不熟悉,誤打誤撞將濃縮膠也一并做了檢測(cè)。檢測(cè)過(guò)程中,他意外地發(fā)現(xiàn)了一種奇怪的現(xiàn)象:他的樣品中, 一個(gè)名為L(zhǎng)EF-10的桿狀病毒晚期表達(dá)因子出現(xiàn)在了濃縮膠里,并且信號(hào)非常強(qiáng)烈 。

(LEF-10出現(xiàn)在濃縮膠中(示意圖)。 Nekout繪制。)

若將這一現(xiàn)象講給一位蛋白試驗(yàn)高手,那么多半他的第一反應(yīng)是“樣品加的太多啦,蛋白變性不徹底”。還是新手的許曉東,也懷疑這是自己操作的bug。

為了解決這個(gè)問(wèn)題,他不停調(diào)整試驗(yàn)方法,奇怪的是, 無(wú)論怎么調(diào)整,LEF-10蛋白都雷打不動(dòng)地“賴”在濃縮膠里不走 。這個(gè)現(xiàn)象引起了許曉東極大的好奇。

許曉東有個(gè)好習(xí)慣,但凡遇到不明白的事情,就立刻去查找資料,甚至窮盡文獻(xiàn),直到獲得令他滿意的解答為止。但是這一回, 他遍歷了圖書(shū)館的相關(guān)書(shū)籍和期刊文獻(xiàn),卻沒(méi)有找到任何相關(guān)記錄 。

他又將這一現(xiàn)象匯報(bào)給導(dǎo)師,向?qū)熣?qǐng)教。但他的導(dǎo)師剛剛申請(qǐng)到HIV相關(guān)的課題,對(duì)他那塊“奇怪的濃縮膠”并不怎么感冒。沒(méi)有導(dǎo)師的支持,這一發(fā)現(xiàn)就此被選擇性的“忽略”了。

不過(guò), 從那時(shí)起,濃縮膠里的異常信號(hào),就一直縈繞在許曉東心頭 。

在黑暗中緩慢前行

2009年,許曉東和妻子陳紅英回到中國(guó),他想找一個(gè)可以遠(yuǎn)離城市的地方安靜做科研,于是選擇了去西北農(nóng)林科技大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院任教。

夫妻二人共同建立起實(shí)驗(yàn)室,也逐漸展開(kāi)新的課題研究。

最讓許曉東惦記的,仍然是濃縮膠里的LEF-10。他一心想搞明白那個(gè)異常信號(hào)到底代表著什么。從英國(guó)到中國(guó),他幾乎逢人就問(wèn),不放過(guò)一絲線索。他帶過(guò)的歷屆學(xué)生,也都知道他的這個(gè)心結(jié)。

不論怎么問(wèn),許曉東聽(tīng)到的答復(fù)始終是“沒(méi)見(jiàn)過(guò)”、“不知道”。而越是這樣,他做下去的決心就越堅(jiān)定。

對(duì)于科研,許曉東一直堅(jiān)信這樣一個(gè)理念: 好的課題,不能僅僅著眼于局部,而是要立意高遠(yuǎn),必須有生物學(xué)上的普遍意義 。

他隱約感覺(jué)到,這個(gè)異常信號(hào)的背后一定蘊(yùn)藏著某些特別的含義。而他的目標(biāo),就是無(wú)論如何也要找到其中隱藏的秘密。

不過(guò),由于沒(méi)有任何可借鑒的先例,許曉東在研究初期完全找不到頭緒。他帶著自己的學(xué)生在黑暗中探路,一條行不通,就換另一條,反反復(fù)復(fù)嘗試,斷斷續(xù)續(xù)摸索,進(jìn)度異常緩慢。

經(jīng)過(guò)很長(zhǎng)一段時(shí)間的努力,許曉東總算收集到一些關(guān)于LEF-10的重要線索。

線索一:聚合體分子量大且不均一

純化后的LEF-10蛋白,會(huì)形成大分子聚合體 。許曉東通過(guò)分子量排阻色譜(一種檢測(cè)物質(zhì)分子質(zhì)量的方法)發(fā)現(xiàn) ,LEF-10形成的聚合體并不是“統(tǒng)一規(guī)格”的,而是分子量不均一的聚合體“集合”。

(LEF-10聚合體分子量大且不均一(示意圖)。Nekout繪制。)

線索二:聚合體常帶有DNA

既然是聚合物,那么就有必要搞清楚它是由什么聚合在一起的:到底是單純的LEF-10蛋白?還是有其他的生物大分子參與?通過(guò)酚氯仿抽提,許曉東竟然從聚合體中獲得了DNA。

(聚合體常帶有DNA(示意圖)。 Nekout繪制。)

線 索三:截短體27-78形成的聚合體分子量呈現(xiàn)嚴(yán)格的倍數(shù)關(guān)系

DNA結(jié)合特性使LEF-10的研究變得復(fù)雜。許曉東便嘗試將這個(gè)蛋白截短,去掉能與DNA結(jié)合的那些氨基酸,看它是否還能形成聚合體。測(cè)試過(guò)多種類型的截短體后,他們發(fā)現(xiàn)當(dāng)保留第27位到第78位氨基酸的部分時(shí),該蛋白不再帶有DNA,但不影響聚合能力。更重要的是, 這些聚合體按分子量呈現(xiàn)出了漂亮的倍數(shù)梯度 。

(截短體27-78形成的聚合體分子量呈現(xiàn)嚴(yán)格的倍數(shù)關(guān)系。Nekout繪制。)

線索四:LEF-10僅在少量細(xì)胞中表現(xiàn)為聚合體形式

后來(lái),許曉東又將綠色熒光蛋白融合在了LEF-10蛋白上,觀察LEF-10在原生細(xì)胞中到底是什么樣子。他發(fā)現(xiàn), LEF-10在極少量的細(xì)胞中能形成有較強(qiáng)熒光信號(hào)的斑點(diǎn) 。而大部分的細(xì)胞中LEF-10都是均勻分布在細(xì)胞中的。

(LEF-10聚合體僅在少量細(xì)胞中出現(xiàn)。圖片來(lái)源:參考文獻(xiàn)[1])

這些線索的碎片拼接在一起,讓黑暗中主人公的影子漸漸顯露出身形。它們?cè)谠S曉東腦海中拼出了一個(gè)單詞—— prion(朊病毒) 。

(被朊病毒感染的組織切片觀察。圖片來(lái)源: Wikimedia Commons)“ 朊病毒 ”這個(gè)概念對(duì)于大部人來(lái)說(shuō),多少有些陌生。它名叫病毒卻不是病毒,而是一類出了bug(錯(cuò)誤折疊)的蛋白質(zhì)。朊病毒具有感染性,有時(shí)會(huì)造成致命的疾病。眾所周知的瘋牛病、阿爾茲海默癥,都與這類蛋白有密不可分的關(guān)系。

(阿爾茲海默癥與這類蛋白有密不可分的關(guān)系。圖片來(lái)源:圖蟲(chóng)創(chuàng)意)

這些出錯(cuò)的蛋白往往具有特殊的結(jié)構(gòu),這種結(jié)構(gòu)能讓它們?cè)谀承l件下相互吸引,肩并肩緊緊粘在一起,形成堅(jiān)實(shí)的高分子聚合體。這樣的聚合體很難被蛋白酶水解,普遍 能夠耐受高溫、輻射和普通的蛋白變性劑 。

這也就解釋了文章開(kāi)頭濃縮膠里那個(gè)異常信號(hào)的成因—— LEF-10和目前已知的大部分朊病毒形成的聚合體類似,具有抵抗SDS變性的特性 。100℃的高溫和SDS的聯(lián)合處理,都沒(méi)有辦法將這種蛋白聚合體拆開(kāi),這樣“大塊頭”的蛋白聚合體自然會(huì)卡在濃縮膠中里出不來(lái)。

另外,許曉東在LEF-10上發(fā)現(xiàn)的現(xiàn)象和朊病毒其他一些特征也能夠?qū)?yīng)上,比如:朊病毒聚合體大多都不均一,分子量會(huì)呈現(xiàn)為倍數(shù)關(guān)系;一般朊病毒的形成需要某些特定的因素,因此僅會(huì)在少數(shù)細(xì)胞中變成聚合體。

這么一來(lái),許曉東的研究前景變得豁然開(kāi)朗。

當(dāng)時(shí),科學(xué)界僅在哺乳動(dòng)物和真菌中發(fā)現(xiàn)過(guò)朊病毒,還 沒(méi)有人報(bào)道過(guò)病毒中的朊病毒 。

他在2013年底的組會(huì)上對(duì)已有的工作做了總結(jié),并將下一階段的目標(biāo)定為: 證實(shí)LEF-10是朊病毒,為“朊病毒廣泛存在假說(shuō)”提供更多實(shí)例 。

論證之路上的一波三折

在探索科學(xué)問(wèn)題的過(guò)程中,從“觀察現(xiàn)象”到“提出假設(shè)”只是邁出了關(guān)鍵的第一步。只有通過(guò)合適的方法證實(shí)和嚴(yán)謹(jǐn)?shù)倪壿嬚撟C,從不同的角度拿到充足的證據(jù),證明現(xiàn)象與原因間的“必然性”,才能得到科學(xué)界的廣泛認(rèn)可。

即便有了研究方向,論證的過(guò)程往往也沒(méi)有那么容易。

研究朊病毒,許曉東將面對(duì)重重困難:他的課題組既沒(méi)有這方面的研究經(jīng)驗(yàn),也沒(méi)有合適的工具和技術(shù)體系。朊病毒研究對(duì)他們來(lái)說(shuō),幾乎是完全陌生的領(lǐng)域。

在沒(méi)有研究基礎(chǔ)的情況下開(kāi)拓新領(lǐng)域,對(duì)他們這樣一個(gè)小課題組來(lái)說(shuō),無(wú)疑要承擔(dān)巨大的風(fēng)險(xiǎn)和挑戰(zhàn)。但是,迎接這樣的挑戰(zhàn),在許曉東看來(lái),正是他做科研的樂(lè)趣所在和動(dòng)力之源。

之后的很長(zhǎng)時(shí)間,許曉東開(kāi)始拼命閱讀朊病毒的相關(guān)文獻(xiàn)。他梳理出朊病毒的 4個(gè)核心特征 :

1、能以非朊病毒和朊病毒兩種穩(wěn)定狀態(tài)存在;

2、其中一種狀態(tài)可以自發(fā)或受某種誘導(dǎo)轉(zhuǎn)變成另一種狀態(tài);

3、在某種情況下,朊病毒狀態(tài)可以被“治愈”;

4、兩種狀態(tài)都可遺傳下去。

也就是說(shuō),LEF-10至少需要通過(guò)這4項(xiàng)考驗(yàn),才有可能拿到朊病毒的“身份證”。而要對(duì)它驗(yàn)明正身,就必須有一套行之有效且能被同行認(rèn)可的鑒定體系。

酵母系統(tǒng)壁壘

目前,在朊病毒領(lǐng)域,學(xué)術(shù)界認(rèn)可的鑒定體系是由已故的著名生物學(xué)家蘇珊·林德奎斯特(Susan Lindquist, 1949-2016)建立的釀酒酵母Sup35p鑒定方法 [2] 。

(蘇珊·林德奎斯特.圖 片來(lái)源: Wikimedia Commons)

對(duì)許曉東而言,通過(guò)這個(gè)鑒定體系證實(shí)LEF-10的朊病毒特性,是讓科學(xué)界承認(rèn)LEF-10是朊病毒的必由之路。

他立刻給 蘇珊 院士的得意門生——酵母朊病毒鑒定的頂級(jí)專家 蘭德?tīng)枴す柗蚵ㄎ恼麻_(kāi)頭提到的那位) 寫郵件尋求這套系統(tǒng), 哈爾夫曼 同意了,并告知他們“這套系統(tǒng)很棘手(tricky),你們做不出來(lái)”,許曉東發(fā)了地址過(guò)去,但最后不知為何始終沒(méi)有收到回復(fù)。

幾經(jīng)輾轉(zhuǎn),直至2014年底,在妻子陳紅英的幫助下,許曉東終于從英國(guó)肯特大學(xué)酵母朊病毒科學(xué)家米克·圖特(Mick Tuite)那里拿到了類似的系統(tǒng)。相較美國(guó)科學(xué)家的系統(tǒng),圖特的系統(tǒng)能夠更加嚴(yán)謹(jǐn)?shù)貙?duì)朊病毒進(jìn)行鑒定。

拿到了酵母系統(tǒng),欣喜之余,暗藏的挑戰(zhàn)接踵而至。

這套系統(tǒng)遠(yuǎn)比許曉東想的復(fù)雜與艱難。一方面是系統(tǒng)自身非常復(fù)雜,需要深厚的遺傳學(xué)背景才能知曉其中的原理。另一方面, 這類實(shí)驗(yàn)操作對(duì)很多細(xì)節(jié)的要求異常嚴(yán)苛 ,最好有熟練掌握這一技術(shù)的人手把手教上好幾年,才能獲得所有要領(lǐng),否則“照著說(shuō)明書(shū)也做不出來(lái)”。

長(zhǎng)久以來(lái),這個(gè)領(lǐng)域的新發(fā)現(xiàn)幾乎都被幾個(gè)酵母領(lǐng)域的研究團(tuán)隊(duì)“壟斷”。所以, 哈爾夫曼 說(shuō)他們“做不出來(lái)”,其實(shí)也不是沒(méi)有道理。

畢竟,與哈佛大學(xué)、麻省理工學(xué)院的資深團(tuán)隊(duì)相比,許曉東他們無(wú)論在試驗(yàn)條件還是技術(shù)經(jīng)驗(yàn)上均存在不言而喻的天壤之別。

然而這些困難絲毫沒(méi)有動(dòng)搖許曉東的決心。他找到了當(dāng)時(shí)正在讀研二的碩士生,南昊。

(南昊(圖左)與許曉東(圖右)。圖片來(lái)源:南昊)

南昊是個(gè)非常擅于思考的學(xué)生,他平時(shí)涉獵廣泛,對(duì)很多科學(xué)問(wèn)題都有自己的獨(dú)特見(jiàn)解,也懂得該如何設(shè)計(jì)試驗(yàn)。

一開(kāi)始,南昊對(duì)這個(gè)課題沒(méi)什么興趣,但沒(méi)過(guò)多久,他就被這個(gè)領(lǐng)域深深吸引,覺(jué)得“越做越有趣”。 南昊漸漸意識(shí)到,這項(xiàng)研究一旦成功,將是一次能夠“更新教科書(shū)”的成果 。

南昊全身心投入到研究中,夜以繼日地做實(shí)驗(yàn)。

事實(shí)證明,“壁壘”是真實(shí)存在的。這套酵母系統(tǒng)非常頑劣,南昊每一步都嚴(yán)格按照論文里提供的方法來(lái)做,但就是做不出結(jié)果,走了很多彎路。

他和許曉東反復(fù)討論細(xì)節(jié)不斷改進(jìn)方案。后來(lái),隨著文獻(xiàn)的不斷積累和操作上的日臻成熟,桀驁難馴的酵母系統(tǒng)一點(diǎn)點(diǎn)低下了高傲的頭顱,漸漸發(fā)揮出了功效。鑒定路上的四道大門被一道道解鎖。

與時(shí)間賽跑

釀酒酵母中,存在一種天然的朊病毒Sup35p。正常情況下,這個(gè)蛋白的功能是讓翻譯過(guò)程在該停的地方停下來(lái)。但受到某些刺激時(shí),Sup35p蛋白會(huì)表現(xiàn)出朊病毒特性,在細(xì)胞中變?yōu)榫奂w,就會(huì)失去對(duì)翻譯過(guò)程的管控,出現(xiàn)許多過(guò)度翻譯延長(zhǎng)的蛋白質(zhì),最終影響酵母的表型。

這樣的變化雖然會(huì)使一些正常的蛋白失去功能,但同時(shí)也會(huì)讓一些提前終止突變(翻譯一半就停了)的蛋白恢復(fù)功能。例如,在釀酒酵母LJ14菌株中,它的腺苷酸合成通路中的ade基因中間就含有一個(gè)由突變產(chǎn)生的提前終止密碼子。

在Sup35p正常發(fā)揮功能時(shí), ade 基因翻譯到一半就終止了,因此LJ14菌株沒(méi)辦法自己合成腺苷酸,只能在額外提供了腺苷酸的培養(yǎng)基上生存。同時(shí), ade 基因的失效,使得腺苷酸合成的前體物在細(xì)胞中積累。

非常有趣的是,這種前體物是一種紅色的色素分子,能讓酵母呈現(xiàn)為紅色。但當(dāng)Sup35p轉(zhuǎn)變?yōu)殡貌《緯r(shí), ade 基因中的提前終止密碼就不起作用了,核糖體能夠通讀過(guò)去,形成有功能的Ade蛋白,酵母就會(huì)變?yōu)榘咨?/p>

這樣一來(lái),只要用其他的DNA序列替代Sup35p,不就可以通過(guò)顏色表型初步檢測(cè)那段序列是否可以編碼朊病毒了?

于是,許曉東和南昊將LEF-10蛋白上的具有朊病毒特征的部分氨基酸替換在了酵母的Sup35p蛋白上。成功的觀察到了和野生Sup35p相似的效果。

1.培養(yǎng)基上既有紅色菌落又有少量白色菌落——說(shuō)明LEF-10能以非朊病毒和朊病毒兩種穩(wěn)定狀態(tài)存在;

2.挑選紅色的菌落中酵母?jìng)鞔?,能觀察到自發(fā)形成的新的白色菌落——說(shuō)明其中一種狀態(tài)可以自發(fā)或受某種誘導(dǎo)轉(zhuǎn)變成另一種狀態(tài);

3.抑制或敲除了能促進(jìn)朊病毒聚集的分子伴侶HSP104之后,LEF-10也會(huì)從朊病毒態(tài)的白色菌落變?yōu)榉请貌《緫B(tài)的紅色菌落——證明在某種情況下,朊病毒狀態(tài)可以被“治愈”;

4.白色菌落傳代能產(chǎn)生白色菌落,紅色菌落傳代也能產(chǎn)生紅色菌落——證明兩種狀態(tài)都可遺傳下去。

(利用酵母系統(tǒng)驗(yàn)證病毒中的朊病毒。圖片來(lái)源:參考文獻(xiàn)[1])

由此,LEF-10的朊病毒特性幾乎可以說(shuō)是板上釘釘了。

除此之外,他們陸續(xù)從其他角度(如該桿狀病毒侵染的昆蟲(chóng)細(xì)胞、SDD-AGE等)共同證實(shí)了LEF-10的朊病毒特性;并找到了對(duì)LEF-10形成聚集體關(guān)鍵的氨基酸殘基位點(diǎn) [1,3] 。

(LEF-10的蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)。圖片來(lái)源:參考文獻(xiàn)[1])

就在他們收集證據(jù)的過(guò)程中,2017年1月,《科學(xué)》雜志上報(bào)道了第一個(gè)細(xì)菌中的朊病毒 [4] ,這讓許曉東團(tuán)隊(duì)受到鼓舞也倍感壓力,他們必須和時(shí)間賽跑,不然很可能被其他人超越。

終于到了投稿的階段,可能由于他們研究的對(duì)象(昆蟲(chóng)病毒)比較“冷門”,先后被幾家頂級(jí)期刊拒稿后,最終被《自然-通訊》正式接收。 在朊病毒鑒定領(lǐng)域中,第一次出現(xiàn)中國(guó)團(tuán)隊(duì)的身影 。

(團(tuán)隊(duì)主要成員許曉東。圖片來(lái)源:南昊)

這項(xiàng)研究成果得到了酵母朊病毒領(lǐng)域元老 米克·圖特 的認(rèn)可(就是前面說(shuō)到的提供酵母系統(tǒng)的教授),也讓許曉東當(dāng)年的導(dǎo)師瓊斯倍感意外,他沒(méi)想到自己的學(xué)生可以把桿狀病毒中的朊病毒做到這個(gè)程度。

啟示

你可能會(huì)問(wèn),病毒中發(fā)現(xiàn)了朊病毒,意味著什么呢?

病毒作為最小的生命形式,一共也沒(méi)有多少基因,這個(gè)蛋白對(duì)桿狀病毒來(lái)說(shuō)有意義嗎?

這里就要回到第二條線索—— LEF-10的聚合體上帶有DNA 。這意味著,它很可能是一種轉(zhuǎn)錄因子,在昆蟲(chóng)體內(nèi)會(huì)控制一些基因的表達(dá)。

病毒感染宿主后會(huì)開(kāi)始大量復(fù)制,當(dāng)他們數(shù)量太多的時(shí)候,就會(huì)過(guò)度消耗宿主的資源,并威脅到宿主的生命。

如果宿主死亡,病毒也就無(wú)法存活。

據(jù)推測(cè),LEF-10蛋白單體行使的本職工作是促進(jìn)病毒復(fù)制,當(dāng)感受到宿主資源不足時(shí),這些單體就開(kāi)始聚集。聚集后的LEF-10不能行使原有功能,從而扼制晚期基因的表達(dá),限制病毒的復(fù)制,讓宿主有喘息之機(jī),最終實(shí)現(xiàn)病毒和宿主間的平衡關(guān)系。

這種調(diào)控方式可以被看成是一種“剎車機(jī)制”(可以理解為“節(jié)育”)。這種機(jī)制有利于病毒在宿主體內(nèi)更長(zhǎng)久的持續(xù)復(fù)制,能夠讓宿主存活更久,將其帶到更遠(yuǎn)的地方“繁衍生息”。

(圖片來(lái)源:參考文獻(xiàn)[1](Nekout漢化))

另一方面,在病毒中發(fā)現(xiàn)朊病毒,也為解釋許多朊病毒相關(guān)的疾病提供了一種新的可能。

比如,長(zhǎng)久以來(lái)困擾著全世界科學(xué)家的 阿爾茲海默癥 。

在這項(xiàng)研究之前,科學(xué)界就早已發(fā)現(xiàn)了一種朊病毒能使另外一種不同的蛋白轉(zhuǎn)化為新的朊病毒 [5-7] 。

例如,在人的神經(jīng)細(xì)胞中淀粉樣蛋白Amyloid beta(Aβ)能引發(fā)Tau蛋白聚集成具有細(xì)胞毒性的富β-片層狀聚合體 [8] 。不僅人自身的內(nèi)源蛋白可以誘發(fā)這一過(guò)程。一些來(lái)自于病原微生物的淀粉樣蛋白也有類似的能力 [9] 。

近年來(lái),已經(jīng)有很多研究發(fā)現(xiàn)病毒感染與阿茨海默癥發(fā)病之間存在關(guān)聯(lián) [10-12] ,但還說(shuō)不清具體的關(guān)系是什么。而這項(xiàng)研究就給了人們一個(gè)新的提示: 如果某些人源病毒,如皰疹病毒,也編碼類似的蛋白,一旦它在某些情況下入侵人腦,并產(chǎn)生朊病毒,就有可能誘發(fā)阿爾茲海默癥。

當(dāng)然,這樣的假設(shè)還有待進(jìn)一步驗(yàn)證,但它為研究病毒感染與阿爾茲海默癥發(fā)病之間的必然性,提供了一個(gè)新的方向。

從困境到曙光

心之所向,雖遠(yuǎn)必達(dá)。

時(shí)至此刻,17年前那次“異?,F(xiàn)象”埋下的小小種子,終于在幾位執(zhí)著的科研人的悉心呵護(hù)下萌芽長(zhǎng)大,為朊病毒在不同生命形式的發(fā)現(xiàn)史蓋上“收官之印”。

而這些年,他們付出了太多常人無(wú)法想象的艱辛。

由于研究方向過(guò)于生僻,許曉東常年申請(qǐng)不到課題,評(píng)不上職稱,至今仍是一位七級(jí)副教授。因?yàn)槿鄙俳?jīng)費(fèi),他也不具備招生資格,大部分實(shí)驗(yàn)都由南昊一人完成,偶爾還需要親自上陣。截至文章接收時(shí),許曉東的賬面經(jīng)費(fèi)已不足千元。

許曉東的妻子陳紅英教授一直很支持他的工作,不惜犧牲一些自己很喜歡的課題,給予許曉東各方面的支持與鼓勵(lì)。

南昊為了這個(gè)課題,畢業(yè)后放棄了考博和工作的機(jī)會(huì),主動(dòng)留在實(shí)驗(yàn)室繼續(xù)做實(shí)驗(yàn),全年沒(méi)有休過(guò)假,甚至過(guò)年都不回家。沒(méi)有補(bǔ)助,就在實(shí)驗(yàn)間隙出去打工賺錢。

多年的堅(jiān)守與付出終于有了回報(bào)。許曉東在日志中認(rèn)認(rèn)真真感謝了每一位給予過(guò)他幫助的人,并感慨的寫下這樣一句話:“ 我們終究是幸運(yùn)的,終于活著看見(jiàn)了今天的朝霞 ?!?/p>

病毒中發(fā)現(xiàn)阮病毒的故事,講到這里也接近尾聲。它源于不經(jīng)意的好奇,陷于刨根問(wèn)底的探尋,又歸于波瀾不驚的平靜。

不過(guò),這個(gè)小團(tuán)隊(duì)沒(méi)有就此停下前行的腳步,他們準(zhǔn)備繼續(xù)深入研究LEF-10的功能和結(jié)構(gòu),并著手開(kāi)發(fā)一套鑒定朊病毒的原核系統(tǒng),為更多想做朊病毒研究的學(xué)者提供方便可行的工具。

與此同時(shí),已經(jīng)有其他做病毒的課題組也在濃縮膠中發(fā)現(xiàn)了相似的“異常信號(hào)”,聯(lián)系他們幫忙鑒定;還有的課題組找到他們合作解析LEF-10的蛋白結(jié)構(gòu)。而這樣的合作,放在以前是不可能發(fā)生的事。

未來(lái),還會(huì)有更多病毒中的朊病毒被學(xué)者們發(fā)現(xiàn)和研究。那時(shí)候,一定會(huì)有一篇來(lái)自中國(guó)的研究出現(xiàn)在他們的引文中: A viral expression factor behaves as a prion .

作者名片

排版:小爽

參考文獻(xiàn):

1.Hao Nan, Hongying Chen, Mick F. Tuite & Xiaodong Xu. A viral expression factor behaves as a prion. Nature Communications, 10: 359 (2019)

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