[科普中國]-有效群體大小

在群體遺傳學(xué)中，美國遺傳學(xué)家Sewall Wright在兩篇標志性的論文中引入了有效群體大小這一概念。有效群體大小可能有兩種定義方式，即方差有效群體大?。╲ariance effective size）和近交有效群體大?。╥nbreeding effective size）。兩種定義由F-統(tǒng)計衍生而來并緊密相連。

概念來源在群體遺傳學(xué)中，美國遺傳學(xué)家Sewall Wright在兩篇標志性的論文中引入了有效群體大小這一概念。他定義其為“在一個理想群體中，在隨機遺傳漂變影響下，能夠產(chǎn)生相同的等位基因分布或者等量的同系繁殖的個體數(shù)量?！庇行后w大小是很多群體遺傳學(xué)模型中的基本參量，通常小于絕對的種群大?。∟）。1

釋義有效群體大小可能有兩種定義方式，即方差有效群體大小（variance effective size）和近交有效群體大?。╥nbreeding effective size）。兩種定義由F-統(tǒng)計衍生而來并緊密相連。

方差有效群體大小在Wright-Fisher理想種群模型中，在給定上一代等位基因頻率p時，等位基因頻率p'的條件方差A(yù)為：

用B來表示該當(dāng)前群體相同或通常更大的方差。2則：

方差有效群體大小Ne定義為具有相同方差的理想種群的大小。此時令A(yù)和B相等并對N求解，可得到：

近交有效群體大小另一種定義，近交有效群體大小通過近交系數(shù)相鄰兩代之間的變化來計算，此時Ne定義為和理想群體的具有相同近交變化的種群大小。3

對于理想群體，近交系數(shù)依以下遞歸方程式計算：

利用回歸交配指數(shù)(1 ?F)代替近交指數(shù)得到近似遞歸方程式：

每一世代的差值是：

通過解：

可得出近交有效群體大小為：

本詞條內(nèi)容貢獻者為:

屈明 - 副研究員 - 西南大學(xué)