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[科普中國]-固氮細(xì)菌

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固氮細(xì)菌是一種能進(jìn)行生物固氮的各種原核生物的通稱,包括自生固氮菌、共生固氮菌、聯(lián)合固氮細(xì)菌三種;固氮細(xì)菌可提高土壤肥力、將一氧化碳變?nèi)剂系茸饔谩?

基本信息固氮細(xì)菌是一種能進(jìn)行生物固氮的各種原核生物的通稱,一般情況下它可分為三大類,這其中包括自生固氮菌、共生固氮菌和聯(lián)合固氮菌這三種。固氮酶對氧極其敏感,因此固氮作用必須在嚴(yán)格的厭氧條件下進(jìn)行,這對于厭氧固氮菌當(dāng)然不成問題。但是大多數(shù)固氮菌卻是必須在有氧條件下才能生活的好氧菌,這里有一些保護(hù)固氮酶免受氧傷害的機制可以保護(hù)好。釩固氮酶通??梢詮牡獨庵猩砂?,所以說固氮菌可以將一氧化碳變?nèi)剂稀?/p>

分類自生固氮菌指各種自由生活、能獨立固定大氣氮的原核生物,包括多種生理類型的種類,如化能異養(yǎng)、好氧性的固氮菌屬(Azotobacter)、化能異養(yǎng)、兼性厭氧的克雷伯氏菌屬(Klebsiella)和化能異養(yǎng)、專性厭氧的巴氏梭菌(Clostridium pasteurianum),光能自養(yǎng)、好氧性的念珠藍(lán)細(xì)菌屬(Nostoc)、光能異養(yǎng)、兼性厭氧的紅螺菌屬(Rhodospirillum)和光能自養(yǎng)、專性厭氧的著色菌屬(Chromatium)等。

共生固氮菌指必須與它種生物共生時才能固氮的原核微生物。包括與豆科植物共生結(jié)根瘤的根瘤菌屬(Rhizobium)、與非豆科植物共生結(jié)根瘤的弗蘭克氏菌屬(Frankia)放線菌以及與地衣共生的魚腥藍(lán)細(xì)菌屬(Anabaena)等。

聯(lián)合固氮菌指必須生活在植物根際、葉面或動物腸道等處才能固氮的原核生物。包括在熱帶植物根際固氮的固氮螺菌屬(Azospirillum)以及在葉面固氮的拜葉林克氏菌屬(Beijerinckia)等。所有的固氮菌都有固氮酶,在有氧障保護(hù)的嚴(yán)格厭氧微環(huán)境中進(jìn)行固氮。生物固氮對全球生物圈的存在、繁榮與發(fā)展極端重要,對人類的生存和農(nóng)業(yè)增產(chǎn)也有極其重要的作用。1

保護(hù)好氧固氮菌防止氧傷害其固氮酶的機制

固氮酶對氧極其敏感,因此固氮作用必須在嚴(yán)格的厭氧條件下進(jìn)行。這對于厭氧固氮菌當(dāng)然不成問題。但是大多數(shù)固氮菌卻是必須在有氧條件下才能生活的好氧菌,它們是如何解決需氧但又必須防止氧傷害其固氮酶這個矛盾的呢?已知有以下一些保護(hù)固氮酶免受氧傷害的機制:

1.固氮菌保護(hù)固氮酶的機制

⑴呼吸保護(hù)

固氮菌屬的許多細(xì)菌以其較強的呼吸強度迅速耗去固氮部位周圍的氧,以使固氮酶處于無氧的微環(huán)境中而免受氧的傷害。

⑵ 構(gòu)象保護(hù)

褐球固氮菌等有一種起著構(gòu)象保護(hù)功能的蛋白質(zhì)——Fe-S蛋白質(zhì)Ⅱ,在氧分壓增高時,它與固氮酶結(jié)合,此時,固氮酶構(gòu)象發(fā)生改變并喪失固氮活力;一旦氧濃度降低,該蛋白便自酶分子上解離,固氮酶恢復(fù)原有的構(gòu)象和固氮能力。

2.藍(lán)細(xì)菌保護(hù)固氮酶的機制

進(jìn)行產(chǎn)氧光合作用的藍(lán)細(xì)菌普遍有固氮能力,其具有獨特的保護(hù)固氮酶機制。

分化有異形胞的絲狀細(xì)菌在異形胞中進(jìn)行固氮作用。異形胞是部分藍(lán)細(xì)菌適應(yīng)于有氧條件下進(jìn)行固氮作用的特殊細(xì)胞。它有很厚的細(xì)胞壁,缺乏產(chǎn)氧光合系統(tǒng)Ⅱ,有高的脫氫酶和氫化酶活力,這些特性使異形胞保持高度的無氧或還原狀態(tài),固氮酶不會受氧的傷害。此外,異形胞還有高的超氧化物歧化酶活力,有解除氧毒害的功能;其呼吸強度也高于鄰近的營養(yǎng)細(xì)胞。

沒有異形胞分化的藍(lán)細(xì)菌有的將固氮作用與光合作用分開進(jìn)行(黑暗下固氮,光照下進(jìn)行光合作用),如織線藍(lán)細(xì)菌屬等;有的在束狀群體中央失去光合系統(tǒng)Ⅱ的細(xì)胞中進(jìn)行固氮作用,如束毛藍(lán)細(xì)菌屬;有的則通過提高細(xì)胞內(nèi)過氧化物酶或超氧化物歧化酶活力以解除氧毒害,如粘球藍(lán)細(xì)菌屬等,以保護(hù)固氮酶。

3.根瘤菌保護(hù)固氮酶的機制

與豆科植物共生的根瘤菌以類菌體形式生活在豆科植物根瘤中,根瘤不僅提供根瘤菌以良好的營養(yǎng)環(huán)境,還為根瘤菌固氮酶提供免受氧傷害的場所。類菌體周圍有類菌體周膜包著,膜上有一種能與氧發(fā)生可逆性結(jié)合的蛋白——豆血紅蛋白(Lb),它與氧的親合力極強,起著調(diào)節(jié)根瘤中膜內(nèi)氧濃度的功能,氧濃度高時與氧結(jié)合;氧濃度低時又可釋放出氧。從而既保證了類菌體生長所需的氧,又不致對其固氮酶產(chǎn)生氧傷害。

非豆科植物共生根瘤菌(如共生在糙葉山麻黃根瘤中的豇豆根瘤菌)依靠非豆科植物所含的植物血紅蛋白(具有與豆血紅蛋白類似功能的蛋白)保護(hù)著固氮酶免受氧傷害。共生在赤楊、楊梅和山麻黃等非豆科植物根瘤中的弗蘭克氏屬放線菌在其營養(yǎng)菌絲末端膨大的球形囊——泡囊中進(jìn)行固氮作用。泡囊與藍(lán)細(xì)菌的異形胞相似,有保護(hù)固氮酶免受氧傷害的功能。2

應(yīng)用固氮菌將一氧化碳變?nèi)剂?/strong>

丙烷是一種點燃后形成藍(lán)色火焰的氣體,全美火爐排放的氣體都含有丙烷。釩固氮酶通??梢詮牡獨庵猩砂薄?茖W(xué)家警告說,這項研究尚處于早期階段,不過他們同時表示,該研究最終可能會帶來全新、環(huán)保的燃料生產(chǎn)方式,最終從稀薄的空氣提取汽油。參與實施這項研究的美國加州大學(xué)歐文分??茖W(xué)家馬庫斯-里貝(Markus Ribbe)說:“這種微生物是一種非常常見的土壤細(xì)菌,我們對其已有深入了解,并且實施了長期的研究?!?/p>

研究結(jié)果刊登在最新一期的《科學(xué)》雜志上。里貝補充說:“雖然我們?nèi)栽谘芯库C固氮酶,但我們知道這種酶具有不同尋常的特性?!笨茖W(xué)家研究的那種微生物名叫棕色固氮菌(Azotobacter vinelandii),是一種對環(huán)境很重要的細(xì)菌,它通常存在于像大豆等固氮植物根部周圍的土壤中。

農(nóng)場主之所以對含有棕色固氮菌的植物情有獨鐘,是因為這種細(xì)菌可充分利用多種酶,將大氣中毫無用途的氮氣變成重要的氨和其他化合物。接下來,其他植物吸收這些化合物,利用它們生長。里貝在研究中與合作者將一種氮——釩固氮酶——隔離出來,用以將氮變成氨。接著,他們從釩固氮酶中分離出氮和氧,并用一氧化碳填補剩余空間。

沒有了氮和氧,釩固氮酶開始將一氧化碳變成兩到三個原子長的短碳鏈。一個三碳鏈通常被稱為丙烷,這是一種點燃后形成藍(lán)色火焰的氣體,全美的火爐都在使用。加利福尼亞理工學(xué)院的科學(xué)家喬納斯-彼得斯說,從科學(xué)上講,釩固氮酶的新功能是一項“意義深遠(yuǎn)的發(fā)現(xiàn)”。

空氣變汽油還需時日

里貝說:“很顯然,如果我們可以制造出更長的碳碳鏈,這項發(fā)現(xiàn)最終會令我們開發(fā)出合成液態(tài)燃料?!毙旅钢荒苄纬蓛傻饺齻€碳鏈,而不是構(gòu)成液態(tài)汽油的更長鏈。不過,里貝認(rèn)為他可以對釩固氮酶做出改動,令其可以生成汽油。如果這項技術(shù)得到進(jìn)一步完善,最終或能令汽車以自身排放的尾氣當(dāng)作部分燃料。而經(jīng)過更長時間的研究,汽車甚至還能從空氣中“吸收”二氧化碳供其運行的燃料,而目前已經(jīng)擁有將二氧化碳變?yōu)橐谎趸嫉募夹g(shù)。

里貝和彼得斯均表示,在近期內(nèi)還不能做到這一步。里貝說:“提取釩固氮酶的難度非常大?!庇捎谄湓谵r(nóng)業(yè)方面的重要性,科學(xué)家很早以前就對這種酶有了了解。他們甚至在20多年前就隔離出釩固氮酶的基因,為遺傳工程師和合成生物學(xué)家深入了解這種酶創(chuàng)造了條件。不過,大量提取、生長和儲存釩固氮酶的技術(shù)直到近幾年才開發(fā)出來,也令這項最新研究成為可能。在開發(fā)出以空氣和細(xì)菌為燃料的汽車以前,科學(xué)家還必須實施進(jìn)一步研究。2

本詞條內(nèi)容貢獻(xiàn)者為:

郭亮 - 副教授 - 中國海洋大學(xué)