紅薯又叫番薯,山芋,地瓜,是喜溫作物,不耐寒。紅薯最初是由明朝萬歷年間福建華僑陳振龍將其帶回了中國(guó),在糧食生產(chǎn)遠(yuǎn)遠(yuǎn)供不應(yīng)求的古代,這種高產(chǎn)的塊根類作物在救荒年代很快傳播到浙江、山東、河南等地,救了很多人的命。
圖1 甘薯一覽
甘薯,最重要的特征是它的塊根中富含淀粉,甘薯儲(chǔ)藏根中的大量淀粉可以用作工業(yè)生產(chǎn)的原材料。淀粉主要是由直鏈和支鏈淀粉構(gòu)成,確切地說,高直鏈淀粉相對(duì)于支鏈淀粉具有更好的工業(yè)性能和工業(yè)利用價(jià)值。直鏈淀粉,就是我們平??吹降挠龅庖鹤兯{(lán)的那種,在工業(yè)上可用來制作薄膜、涂料、粘合劑等,尤其是制作可降解薄膜,代替聚乙烯等塑料,非常環(huán)保。但是呢,目前自然甘薯品系直鏈淀粉含量介于15%-30%之間,不能滿足工業(yè)上的應(yīng)用需求。這就需要我們對(duì)甘薯的淀粉品質(zhì)進(jìn)行改良。
圖2 淀粉中糖苷鍵示意圖
直鏈淀粉,是由許多D-葡萄糖通過α-1,4-糖苷鍵連接成一條直鏈;支鏈淀粉則是在有一些直鏈葡萄糖通過α-1,6-糖苷鍵連接在其他直鏈上,形成像樹杈一樣的支鏈淀粉。直鏈淀粉的分子間容易結(jié)合,易發(fā)生凝沉,糊化(糊化就是溶脹但不溶解,這是一種高聚物中間態(tài),比如用100℃度沸水去煮無論直的還是支的都能完全糊化,但若是60℃溫水則只有支鏈能溶脹)越難,而其切應(yīng)力強(qiáng), 成膜性能較佳。若是理化修飾直鏈淀粉,則可使其功能增強(qiáng)。
目前,從基因調(diào)控層面對(duì)淀粉可以進(jìn)行有效的品質(zhì)改良。所謂基因,是指生物細(xì)胞內(nèi)有遺傳能力的物質(zhì),它們可以指導(dǎo)細(xì)胞合成各種蛋白質(zhì),并向生物細(xì)胞發(fā)出各種“命令”,引導(dǎo)生物發(fā)育與生命機(jī)能的運(yùn)作。那么如何不讓一個(gè)基因發(fā)揮功能呢?
有三種方法:(1)從源頭抓,把那個(gè)基因給弄得不轉(zhuǎn)錄了;(2)讓基因轉(zhuǎn)錄出的RNA失效;當(dāng)DNA轉(zhuǎn)錄出的RNA被清除時(shí),遺傳信息傳遞不下去,這個(gè)基因也相當(dāng)于沒法發(fā)揮功能了,就好比司令部被屏蔽了,下面的軍隊(duì)接收不到信號(hào)了,這就是RNA干擾技術(shù)的原理;(3)把這基因產(chǎn)生的蛋白質(zhì)給清除掉。
我們今天著重講一下從源頭抓,就是基因編輯技術(shù)。它與我們常聽的轉(zhuǎn)基因育種技術(shù)完全不同,這個(gè)操作不轉(zhuǎn)入 “別人家的”基因,只是對(duì)作物內(nèi)部存在的基因進(jìn)行修飾,比如敲除一些“不良基因”。目前應(yīng)用最為廣泛的基因編輯技術(shù)非CRISPR/Cas9莫屬了。CRISPR全稱為clustered regularly interspaced short palindromic repeats,是細(xì)菌中成簇存在的具有規(guī)律間隔的短回文重復(fù)序列,是細(xì)菌通過切割雙鏈DNA使其斷裂而獲得性免疫抵抗病毒入侵的有效手段;Cas為CRISPR associated protein,即CRISPR相關(guān)蛋白,本質(zhì)是一種DNA內(nèi)切酶。圖2為大家簡(jiǎn)單介紹了一下原理:CRISPR是那段綠色序列,與某個(gè)基因組序列匹配上了,Cas蛋白在識(shí)別序列的旁邊把DNA分子切斷,而后生物體會(huì)啟動(dòng)DNA雙鏈斷裂修復(fù)機(jī)制,這個(gè)機(jī)制一般會(huì)導(dǎo)致斷口處少一部分,就會(huì)導(dǎo)致此處的基因被破壞,那么也就達(dá)到了基因敲除的目的。打個(gè)比方,就好比是警察按照指紋,嚴(yán)格匹配到嫌疑犯,而后將其抓獲(切斷DNA),這大概就是CRISPR/Cas9的原理。
圖3 CRISPR/Cas9原理簡(jiǎn)圖
CRISPR/Cas9介導(dǎo)的基因組編輯是分子育種的革命性技術(shù),已成功對(duì)水稻、番茄、馬鈴薯等多種農(nóng)作物進(jìn)行了品質(zhì)改良。然而,這樣的好技術(shù)卻沒有對(duì)甘薯育種帶來太大改善。
這是因?yàn)楦适砘蚪M龐大(有90條染色體),遺傳背景復(fù)雜(異源六倍體),自交不親和,遺傳轉(zhuǎn)化困難,使得甘薯基礎(chǔ)研究嚴(yán)重滯后,新品種培育和品質(zhì)改良十分困難。
但是,只要思想不滑坡,辦法總比困難多!
2019年9月,以王紅霞博士為第一作者,張鵬研究員為通訊作者在International Journal of Molecular Sciences雜志發(fā)表了一篇論文,首次實(shí)現(xiàn)了CRISPR/Cas9編輯甘薯淀粉合成基因,改良淀粉的品質(zhì)。他們成功使用CRISPR/Cas9技術(shù)對(duì)負(fù)責(zé)甘薯直鏈淀粉合成的GBSSI基因和負(fù)責(zé)支鏈合成的SBEII基因進(jìn)行編輯,從而分別獲得高支鏈和高直鏈的淀粉。這,是對(duì)甘薯淀粉品質(zhì)改良的一大進(jìn)步!這為食品加工及工業(yè)應(yīng)用提供新型原材料,也為今后甘薯的育種提供了新的思路和技術(shù)。所以以后,我們想要什么類型的淀粉就有什么,這就是精準(zhǔn)的編輯基因的魅力。這,就是,科技的力量。
出品:科普中國(guó)
監(jiān)制:中國(guó)作物學(xué)會(huì) 光明網(wǎng)科普事業(yè)部
統(tǒng)籌:程維紅 徐琴
策劃:宋雅娟 趙清建
作者:王紅霞 鞠好慶 張鵬
中國(guó)科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心
國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃資助項(xiàng)目((2018YFD1000700, 2018YFD1000705)