奧根診斷cfDNA多模態(tài)片段組學在肝移植中的研究受邀在ATC2024展示

2024年美國器官移植大會將于6月1日~5日（美東時間）在美國賓夕法尼亞州費城舉行，奧根診斷研發(fā)團隊關(guān)于“cfDNA多模態(tài)片段組學在肝移植中的研究”成果非常榮幸受邀在本屆ATC進行壁報展示。

cfDNA作為一個在臨床應(yīng)用廣泛的生物標志物，其含有多維度的生物信息，包括片段大小分布、末端基序（End motif）、鋸齒末端（Jagged ends）、首選末端坐標（Preferred end coordinates）、核小體足跡和基因表達推斷等。cfDNA片段組學就是一項利用cfDNA這些多維特征來識別其組織來源并反映生理病理狀態(tài)的新興技術(shù)。

目前的研究表明，cfDNA片段組學可作為腫瘤學、無創(chuàng)產(chǎn)前檢測、自身免疫性疾病的生物標志物。例如，一些研究發(fā)現(xiàn)，Dnase1l3基因的缺失可能導(dǎo)致cfDNA片段長度和末端基序頻率的改變。在肝細胞癌患者中，血漿cfDNA的末端基序多樣性顯著增加，并且在其他癌癥類型的患者中也觀察到異常的末端基序。

而在器官移植領(lǐng)域，游離DNA（cfDNA）的應(yīng)用僅局限于研究單純定量供體來源cfDNA與排斥反應(yīng)之間的關(guān)系。奧根診斷研發(fā)團隊通過分析了74例肝移植患者術(shù)后兩周的cfDNA測序數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)在不同%ddcfDNA水平下，存在顯著變化的末端基序，并且利用深度學習模型LDLM對患者進行分類。LDLM模型在訓練集和驗證集上表現(xiàn)優(yōu)異，充分挖掘了cfDNA片段組學的信息。在測試集上，LDLM模型取得了0.73的靈敏度和0.78的AUC值。

奧根團隊是全球首個在術(shù)后早期肝移植片段組學開展研究的團隊。這項研究提出了一種新方法，利用cfDNA片段組學監(jiān)測ddcfDNA水平，強調(diào)了其重要性，并驗證了LDLM模型在準確分類肝移植患者方面的有效性，這對于移植器官排斥診斷的進展具有重要意義。

關(guān)于美國移植大會（ATC）

美國移植大會（ATC）是美國移植外科醫(yī)生協(xié)會（ASTS）和美國移植協(xié)會（AST）的聯(lián)合年會，是國際器官移植領(lǐng)域最具影響力的學術(shù)盛會之一，大會聚焦全球移植領(lǐng)域熱點，匯集器官移植最新前沿科學研究成果。今年是第15屆ATC大會，屆時將有來自54個國家的4500+器官移植領(lǐng)域的頂級專家學者參會，預(yù)計將有600+前沿科學研究成果在本屆ATC展出。

封面來源：

Ding SC, Lo YMD. Cell-Free DNA Fragmentomics in Liquid Biopsy. Diagnostics. 2022; 12(4):978. https://doi.org/10.3390/diagnostics12040978