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啥情況? 蘇州出現(xiàn)與全球已知毒株不同源變異株!

李雷
原創(chuàng)
中科院生物學(xué)博士。擅長生物、醫(yī)學(xué)、健康。年更新近300圖文
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3月28日,蘇州常熟市發(fā)現(xiàn)的一例輕型確診病例楊某,其感染的病毒,經(jīng)測序?qū)Ρ葹閂OC/Omicron變異株BA.1.1進(jìn)化分支,在本土病例和輸入病例數(shù)據(jù)庫、全球新冠病毒GISAlD數(shù)據(jù)庫中均未發(fā)現(xiàn)新冠病毒基因組高度同源序列。

經(jīng)過兩年多的抗疫,人們對新冠可謂深惡痛絕,但新冠卻仍舊不厭其煩地變著花樣來干擾人們的生活。這不,繼新毒王XE后,在蘇州又發(fā)現(xiàn)一例新的變異株 BA.1.1 ,與全球已知毒株不同源。這還真的沒完沒了了!抗疫之路任重道遠(yuǎn)啊!

今天就來和大家說說蘇州發(fā)現(xiàn)的新變異株,對我們來說意味著什么?在我們的疫情防控方面有哪些注意事項(xiàng)!

01,新病毒株

先定義為病毒株,根據(jù)進(jìn)化發(fā)展情況再看是否要變成分支(也就是后續(xù)有沒有規(guī)模擴(kuò)散)

剛看到這個(gè)新聞,第一時(shí)間去gisaid 里查了下,結(jié)果沒找到~

最近一次上傳是3月11日,而蘇州這個(gè)序列還沒上傳到gisaid 。所以只能等看到序列后再分析。目前有幾個(gè)事情可以探討的。

02,官方分析屬于BA.1.1

蘇州官方分析屬于BA.1.1,但是屬于這一支下面的新變異,目前全球未報(bào)道過該變異株。

不過其實(shí)也很正常,新冠有很多毒株,初步不下幾千,但是大部分毒株也就是出現(xiàn)了,然后就沒然后了。最終形成氣候的,一定是那種某一方面或者幾方面都具備優(yōu)勢的毒株,最后成為了大家公認(rèn)的xx進(jìn)化分支。

事實(shí)上,哪怕是大家如今肆虐全球的奧密克戎,從出現(xiàn)到變異成強(qiáng)大病毒株,也經(jīng)歷了不短的時(shí)間。

而這期間,其他的不少毒株根本就擴(kuò)散不下去。

形成真正傳播性的幾個(gè)毒株也是某一時(shí)刻獲得了關(guān)鍵性變異,從而讓他們可以取得了傳播上的優(yōu)勢。

03,擴(kuò)散速度方面

從國際上BA.1.1擴(kuò)散速度一般,比不上BA2,所以基于這一點(diǎn),可以初步心理有個(gè)底,不需要特別的傾盡全力去防它。當(dāng)前還是集中精力應(yīng)對某地的BA2吧。

不過總體上,相比于最早的新冠,都有不小的變化(下圖是spike receptor-binding domains (RBDs) 以及人類ACE2的結(jié)構(gòu),可以像找茬一樣肉眼看得到差異)

04,這病毒株咋來的?

說了這么多,最令人好奇的是,這病毒株是咋來的?

目前國內(nèi)是BA 2,要知道從BA 2變成BA 1.1,那難度是相當(dāng)?shù)拇?。所以昨天也和一些朋友探討過,覺得直接變過來可能性較小。但是它就是出現(xiàn)了,所以,它到底從何而來???

大家可以看一下BA2和BA1之間的差異,突變這么多,還要如此精準(zhǔn),這是被定向基因編輯了么?

所以有三個(gè)可能:

1,蘇州測錯(cuò)了-重測,確認(rèn)(但是考慮到既然開發(fā)布會了,那大概率是真的,但是還是要進(jìn)一步檢測,看到底多真實(shí),這個(gè)時(shí)候就不能用二代測序了,而是要上金標(biāo)準(zhǔn)一代測序來看了。)

2,這個(gè)病毒有其他獨(dú)立來源-溯源,病毒不可能無中生有(這個(gè)是重點(diǎn)要做的),事實(shí)上,一個(gè)獨(dú)特的毒株出現(xiàn),一定有前期的變異歷史沿革,這一過程肯定也是漫長的。

我們這段時(shí)間的確沒有進(jìn)行大規(guī)模的全基因組測序,所以可能已經(jīng)存在不少感染了這一支毒株的,但是沒有進(jìn)行大規(guī)模全基因組測序,所以沒有發(fā)現(xiàn)。

(核酸檢測是檢測不出毒株的,要進(jìn)行毒株鑒定必須全基因組測序)

3,這個(gè)病毒天賦異稟。由BA2變成BA1-無語(那只能說是小概率事件發(fā)生了),罕見到難以置信的地步。

就像下圖,BA1和BA2差異那是相當(dāng)?shù)拇?/p>

評論
機(jī)靈的和藹可親軍師
庶吉士級
病毒的復(fù)制與更新也是有規(guī)律可循
2022-04-10
Fu Jicai
少師級
認(rèn)識病毒變異規(guī)律!
2022-04-12
科普61a360c517ff6
學(xué)士級
新冠有很多毒株,初步不下幾千,但是大部分毒株也就是出現(xiàn)了,然后就沒然后了。最終形成氣候的,一定是那種某一方面或者幾方面都具備優(yōu)勢的毒株,最后成為了大家公認(rèn)的xx進(jìn)化分支
2022-04-13