本文歸納了滅活病毒的若干種方式及其滅活原理,大家可據(jù)此尋找合適的消殺方法。同時(shí),我們還會(huì)看到,新冠滅活疫苗也許還有更多的發(fā)展空間。
撰文 | 彭程(清華大學(xué)李賽實(shí)驗(yàn)室博士研究生)、李賽(清華大學(xué)結(jié)構(gòu)生物學(xué)高精尖創(chuàng)新中心研究員)
人類的發(fā)展歷史也是一部病毒抗?fàn)幨罚仡櫄v史長河,病毒已對(duì)人類展開過無數(shù)次猛烈的進(jìn)攻。根據(jù)推測,天花病毒在一萬多年前就已經(jīng)出現(xiàn),直到1980年之前一直在世界各地橫行。天花致死率很高,僅在20世紀(jì)就造成全世界約3億人死亡[1]。流感病毒在近一百多年也多次肆虐全球,僅1918年的西班牙大流感便奪去了數(shù)以千萬計(jì)的生命[2]。此外,人類免疫缺陷病毒(俗稱“艾滋病毒”)、埃博拉病毒、肝炎病毒依舊對(duì)人類虎視眈眈,當(dāng)前新型冠狀病毒也因其突變株的不斷出現(xiàn)而持續(xù)表現(xiàn)出強(qiáng)勁的傳播特性。截至目前,本次新冠疫情的死亡人數(shù)也已經(jīng)上升到人類歷史上病毒瘟疫致死人數(shù)的第三位(自Wikipedia)。面對(duì)這個(gè)看不見的敵人,人類仿佛顯得有些被動(dòng),難道我們不能主動(dòng)去“殺死”病毒嗎?
其實(shí)在還未認(rèn)識(shí)病毒時(shí),人類就已經(jīng)摸石頭過河,摸索出了一些“殺死”病毒的方法。我國古代醫(yī)學(xué)對(duì)此也有所記載,有些方法現(xiàn)在來看仍具有科學(xué)指導(dǎo)意義。如李時(shí)珍在《本草綱木》中記載的“天氣瘟疫,取出病人衣服于甑上蒸過,則一家不染”就是利用高溫“殺死”病毒的例子。隨著生物學(xué)、物理學(xué)、現(xiàn)代醫(yī)學(xué)和化學(xué)的進(jìn)步,人類對(duì)病毒的認(rèn)知也從原來的“邪氣”、“上帝的懲罰”到現(xiàn)在的“一種專營寄生的微小生物顆?!保@也為“殺死”病毒的手段開發(fā)提供了生物學(xué)依據(jù)。
如今,人們已經(jīng)擁有多種“殺死”病毒的手段,有些能破壞病毒結(jié)構(gòu)而快速“殺死”病毒,如酒精(破壞囊膜)、高溫(蛋白變性),這類也是目前消殺的常用手段,有些方法能在“殺死”病毒的基礎(chǔ)上保留病毒的免疫原性或結(jié)構(gòu)完整性,如甲醛(固定蛋白)、β-丙內(nèi)酯(破壞核酸),病毒被它們“殺死”后常被用來制備疫苗或用作病毒的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究。
如何才能“殺死”病毒?
其實(shí),“殺死病毒”這個(gè)表述并不準(zhǔn)確。病毒可謂是大自然以“極簡主義”設(shè)計(jì)的生物體之一,其構(gòu)造簡單到僅剩蛋白/脂膜包裹的核酸。在體外它不會(huì)自我復(fù)制,沒有能量消耗,也沒有物質(zhì)的合成與分解,貌似就是個(gè)“死”的狀態(tài),但它一旦侵入到細(xì)胞內(nèi),又可以將整個(gè)細(xì)胞變成自己的生產(chǎn)工廠,繁殖出更多的病毒顆粒來。因此,病毒是否有生命這個(gè)話題一直沒有明確的答案。前文所說的“殺死”,其實(shí)是指讓病毒失去繁殖的能力,也就是讓病毒哪怕遇到宿主也別再“活過來”。在體外,這一過程在病毒學(xué)界則被稱為“滅活”。
若想阻斷病毒的繁殖,首先得要了解病毒的生活周期。病毒顆粒通過其表面的蛋白作為“鑰匙”識(shí)別宿主并進(jìn)入胞內(nèi),利用細(xì)胞的原料和能量復(fù)制自己的基因組,合成自己的蛋白,這些新合成的基因組和結(jié)構(gòu)蛋白會(huì)裝配成子代病毒顆粒后被釋放到胞外。針對(duì)病毒的生命活動(dòng)過程,滅活的思路大體分為三種,一種是破壞病毒的整體結(jié)或病毒的蛋白結(jié)構(gòu),使其喪失侵入細(xì)胞的能力,另一種是“鎖住”病毒的蛋白,使其無法發(fā)揮功能,最后是破壞病毒的基因組,使其基因組無法在胞內(nèi)復(fù)制。
新冠病毒與流感病毒的生活周期[3]。
新冠病毒(左)和流感病毒(右)的生命周期都經(jīng)歷以下步驟:
①進(jìn)入細(xì)胞。病毒顆粒表面蛋白與受體識(shí)別,發(fā)生膜融合并釋放遺傳物質(zhì);
②基因組復(fù)制。新冠病毒誘導(dǎo)細(xì)胞產(chǎn)生雙膜囊泡(DMV)[4]作為其基因組復(fù)制的場所,流感病毒在細(xì)胞核中進(jìn)行基因組復(fù)制;
③病毒蛋白翻譯;
④病毒顆粒組裝和出芽。新冠病毒的組裝發(fā)生在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)-高爾基體中間體(ERGIC),流感病毒在細(xì)胞膜上組裝;
⑤子代病毒釋放。
基于以上思路,各種各樣病毒滅活的方法也隨之誕生。根據(jù)滅活方式分類,可分為化學(xué)滅活和物理滅活兩種。不同的滅活方法對(duì)病毒產(chǎn)生不同的影響,有的方法可以快速滅活病毒,有的方法能夠在滅活病毒的基礎(chǔ)上保留病毒的蛋白結(jié)構(gòu)或免疫原性??茖W(xué)家們也基于不同的滅活手段進(jìn)行著下游的科研,如快速消毒手段的建立、病毒的結(jié)構(gòu)解析、滅活疫苗的開發(fā)等。本文將簡要介紹幾種主要的病毒滅活手段及原理。
化學(xué)滅活
甲醛
大家對(duì)甲醛應(yīng)該不陌生,它的水溶液就是大名鼎鼎的福爾馬林,是一種防腐劑和固定劑。甲醛含有一個(gè)電子缺失的中心碳原子,是親電子的,因此可以與親核體發(fā)生親核加成反應(yīng)。它可以使蛋白質(zhì)氮端的氨基以及側(cè)鏈含氮的氨基酸(如賴氨酸、精氨酸、酪氨酸等)單羥基化,并進(jìn)一步脫水形成亞胺中間體,而這些中間體可以與與精氨酸、酪氨酸的殘基再次反應(yīng)形成亞甲基橋,發(fā)生交聯(lián)。此外,甲醛也可以使腺嘌呤單羥基化,阻止基因的讀取[5]。因此,甲醛既可以對(duì)病毒的蛋白和基因組實(shí)現(xiàn)雙重打擊,還能通過交聯(lián)固定病毒蛋白的結(jié)構(gòu)。由于甲醛能“鎖定”蛋白結(jié)構(gòu),甲醛滅活既是滅活疫苗開發(fā)的主要候選手段,也是結(jié)構(gòu)生物學(xué)家在病毒結(jié)構(gòu)解析中常用的病毒滅活方式[6]。
甲醛與腺嘌呤和賴氨酸的反應(yīng)原理[5]
β-丙內(nèi)酯
β-丙內(nèi)酯是一種主要針對(duì)鳥嘌呤的烷化劑,也被認(rèn)為是一種傾向于破壞核酸的滅活試劑。親電的β-丙內(nèi)酯可與鳥嘌呤發(fā)生親核取代反應(yīng),使β-丙內(nèi)酯開環(huán)和鳥嘌呤烷基化,導(dǎo)致病毒基因組失活[5]。目前,β-丙內(nèi)酯是滅活疫苗開發(fā)中最廣泛使用的滅活劑,但有研究表明β-丙內(nèi)酯也會(huì)對(duì)部分氨基酸進(jìn)行修飾,發(fā)生?;徒宦?lián)反應(yīng)[7]。
β-丙內(nèi)酯與鳥嘌呤的反應(yīng)原理[5]
乙醇
乙醇也就是酒精。乙醇對(duì)病毒的滅活速度很快,尤其是囊膜病毒。囊膜病毒是一類外層由脂雙層包裹的病毒。由于乙醇具有脂、水雙親性,因此乙醇可以增強(qiáng)膜對(duì)水的親和力,同時(shí)減少非極性氨基酸殘基之間的相互作用,從而既能破壞病毒的整體結(jié)構(gòu),又能使病毒蛋白質(zhì)變性[8]。
2021年,Das等人通過分子動(dòng)力學(xué)模擬的手段描述了乙醇對(duì)囊膜病毒的破壞作用,病毒在75%乙醇溶液浸泡后,其囊膜會(huì)發(fā)生瓦解并導(dǎo)致內(nèi)容物的釋放[9]。新冠病毒也是一種囊膜病毒,2020年Annika Kratzel經(jīng)過實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),新冠病毒在高于30%酒精溶液中浸泡30秒后其感染力可下降至本底水平[10]。除乙醇之外,還有很多醇類化合物也能表現(xiàn)出較快的滅活速度,如正丙醇、異丙醇等[10]。由于這些化合物具有滅活速度快,毒性小的特點(diǎn),因此常被用作洗手液的主要成分和物品的表面消毒劑等。
醇類化合物破壞新冠病毒的原理圖[8]
物理滅活
溫度
高溫也是一種常見和常用的滅活手段。在高溫的作用下,維持病毒蛋白二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu)的化學(xué)鍵會(huì)被破壞,導(dǎo)致蛋白質(zhì)變性,使病毒喪失侵染細(xì)胞和復(fù)制的能力。加泰羅尼亞理工大學(xué)的Didac Martí等人利用分子動(dòng)力學(xué)模擬發(fā)現(xiàn)高溫會(huì)引起新冠病毒表面的蛋白尤其是表面蛋白的受體結(jié)合區(qū)域發(fā)生結(jié)構(gòu)變化和氫鍵重排[11]。此外,高溫還可以使核酸的骨架發(fā)生斷裂。
值得一提的是,目前認(rèn)為“較低”高溫(低于41℃)就可以使病毒基因組發(fā)生斷裂,而不影響蛋白結(jié)構(gòu)和功能[5]。2020年,巴斯德研究院的Christophe Batéjat對(duì)新冠病毒的鼻咽拭子樣品進(jìn)行56℃、65℃和95℃的高溫處理,發(fā)現(xiàn)分別經(jīng)過了20min、10min和3min便會(huì)使新冠病毒失活[12]。高溫滅活的手段因其效果穩(wěn)定且具有廣譜性,現(xiàn)在也是作為生物安全廢棄物處理的必需步驟。
紫外光
紫外光是頻率比藍(lán)紫光高的不可見光。根據(jù)國際標(biāo)準(zhǔn)化組織(ISO)的標(biāo)準(zhǔn),紫外光可根據(jù)波長進(jìn)一步分為UVA波段(320–400 nm)、UVB波段(280-320 nm)和UVC波段(200-280nm)等。其中,UVC對(duì)病毒最具有破壞性,隨后依次為UVB、UVA[13],因此UVC也是用來滅活病毒的主要波段。
紫外光對(duì)病毒核酸的破壞方式主要是誘導(dǎo)核酸內(nèi)部形成嘧啶二聚體。當(dāng)紫外光被病毒的核酸吸收后,病毒基因組中相鄰或相對(duì)的兩個(gè)嘧啶會(huì)發(fā)生光化學(xué)融合,形成共價(jià)連接的嘧啶二聚體。嘧啶二聚體由于共價(jià)作用會(huì)給基因組的骨架引入張力,導(dǎo)致基因組骨架斷裂[5]。對(duì)部分病毒而言,紫外光能在病毒完全滅活的基礎(chǔ)上保留病毒的融合活性[14]。對(duì)于新冠病毒,經(jīng)過9分鐘的UVC照射(累計(jì)劑量1048 mJ/cm2)便可使高感染滴度(5 * 106 TCID50/mL)的新冠病毒徹底滅活[13]。雖然UVC的滅活效果好,但其穿透能力較差,普通透明玻璃、衣服、塑料等就能阻擋大部分UVC。因此,UVC常被用在器械物品表面及醫(yī)院、生物安全等級(jí)實(shí)驗(yàn)室的室內(nèi)空間消毒。
相鄰尿嘧啶經(jīng)紫外光照射形成嘧啶二聚體原理圖[5]
電離輻射
電離輻射是一種能導(dǎo)致物質(zhì)原子或分子發(fā)生電離的能量。三種主要的電離輻射技術(shù)是γ輻射、電子束和X射線。γ射線是一種由原子衰變裂解時(shí)放出的射線。電子束(eBeam)即為從電子束加速器中產(chǎn)生的高能電子束。X射線是由原子核外電子的躍遷或受激等作用產(chǎn)生的射線[15]。雖然來源不同,但是對(duì)病毒滅活的機(jī)理基本類似。
電離輻射對(duì)病毒的破壞作用分為直接作用和間接作用。電離輻射可以直接將病毒體內(nèi)分子的化學(xué)鍵打斷,也可以使水分子發(fā)生電離。水分子輻解會(huì)產(chǎn)生各種各樣的高活性自由基。盡管這些自由基的存在時(shí)間極短,但其可以與周圍的蛋白和核酸反應(yīng),產(chǎn)生極大的破壞性,間接對(duì)病毒造成損傷[15]。不過也有人認(rèn)為電離輻射會(huì)主要攻擊病毒的基因組而非蛋白質(zhì)[16]。電離輻射的滅活效果與輻射劑量有關(guān),且不同病毒存在較大差異[16]。隨著發(fā)射源技術(shù)的更新與進(jìn)步,電離輻射滅活技術(shù)也開始應(yīng)用在了疫苗研發(fā)、進(jìn)口國冷鏈包裝消毒等領(lǐng)域。
滅活的病毒就是滅活疫苗嗎?
談到病毒的滅活,自然就離不開滅活疫苗這個(gè)話題。疫苗的作用是為了讓我們的機(jī)體獲得抗原特異的適應(yīng)性免疫。在佐劑的輔助下,疫苗特定的免疫原性可讓我們建立起特異的免疫記憶。當(dāng)下次相同病原體侵襲時(shí),機(jī)體便能快速激活相應(yīng)的免疫系統(tǒng),迅速清除病原體[17]。在由疫苗介導(dǎo)的免疫記憶的建立中,疫苗的免疫原性起著關(guān)鍵的作用,滅活疫苗也不例外。
雖然滅活病毒有一定的安全保障,但是并非被滅活的病毒都還具有正確的免疫原性。從分子層面來講,免疫原性的保留就是病毒表面蛋白完整性和完好性的保留。而從上文可知,病毒滅活的過程中會(huì)不可避免地影響蛋白結(jié)構(gòu)。因此,在滅活疫苗研發(fā)的過程中需要尋找一個(gè)平衡點(diǎn),即,在保證穩(wěn)定徹底滅活病毒的基礎(chǔ)上,盡可能提高病毒的免疫原性。從上個(gè)世紀(jì)初開始,科學(xué)家便不斷嘗試用不同的方式制備具有免疫原性的滅活疫苗,其中也有不少已經(jīng)可以使用和普及的疫苗,包括脊髓灰質(zhì)炎病毒疫苗、甲型肝炎病毒疫苗和狂犬病疫苗等。
目前,滅活疫苗的滅活方式仍以化學(xué)試劑為主,其制備流程大致為:病毒擴(kuò)增——病毒滅活——化學(xué)試劑去毒——病毒純化——添加佐劑——裝瓶。雖然工藝看起來比較傳統(tǒng),但在研發(fā)的過程中仍有幾大難點(diǎn)亟待解決:
1、在制備疫苗之前,需要獲得一株具有良好免疫效應(yīng)的穩(wěn)定種子毒株;
2、需要選擇合適的滅活劑、劑量及處理方式,以保證疫苗的免疫原性;
3、需要對(duì)滅活病毒進(jìn)行高標(biāo)準(zhǔn)的純化;
4、需要較高的工業(yè)水平以支撐超大規(guī)模的快速量產(chǎn)。
這些因素導(dǎo)致一般疫苗從開發(fā)到上市都會(huì)經(jīng)歷大約10年之久。不過,出于科研、工藝水平的進(jìn)步和時(shí)間的緊迫性,我國在分離出首株新型冠狀病毒毒種后不到一年半的時(shí)間內(nèi),自主研發(fā)并上市的滅活疫苗便已經(jīng)獲得了世衛(wèi)組織的緊急使用授權(quán)。
相比于其他疫苗,滅活疫苗具有研發(fā)周期短、工藝相對(duì)成熟、安全較有保證、易于保存和運(yùn)輸?shù)膬?yōu)勢(shì)。但滅活疫苗自身也有一些弱點(diǎn),如為應(yīng)對(duì)病原快速變異的疫情,常需針對(duì)變異毒株更新疫苗,核酸類疫苗的更新速度相對(duì)滅活疫苗可能更快。此外,對(duì)于一些抗原穩(wěn)定性較差的病毒,傳統(tǒng)滅活方式難免會(huì)損壞免疫原性。有研究發(fā)現(xiàn),新冠病毒經(jīng)過0.05%的β-丙內(nèi)酯4℃敷育36h后,其表面74%的蛋白構(gòu)象已不再具備正確的免疫原性[18],這也側(cè)面說明滅活疫苗的研制仍有很大的開發(fā)潛力。
經(jīng)多聚甲醛[6]與β-丙內(nèi)酯[18]滅活的新冠病毒的結(jié)構(gòu)和腺病毒疫苗誘導(dǎo)抗原在細(xì)胞表面表達(dá)的電鏡照片[19] 。
圖A和圖B:與多聚甲醛固定后的病毒相比,β-丙內(nèi)酯滅活可能會(huì)造成刺突蛋白發(fā)生巨大的構(gòu)象變化,由倒三角形(餅圖中藍(lán)色)變?yōu)殚L柱形(餅圖中橘黃色)。但并不排除這劇烈變化是發(fā)生在病毒純化時(shí),因?yàn)棣?丙內(nèi)酯處理后的刺突蛋白較甲醛處理后具有更高的自由度。不過,這也并不代表甲醛滅活的病毒免疫原性更高,經(jīng)研究,經(jīng)甲醛固定后可能減少了刺突蛋白上受體結(jié)合區(qū)域的暴露,反而影響了免疫反應(yīng)的誘導(dǎo)[20]。
圖C:一類核酸疫苗——腺病毒疫苗可直接誘導(dǎo)宿主細(xì)胞表達(dá)抗原,刺激機(jī)體免疫反應(yīng),這種方法引入的抗原不會(huì)受到外界損壞。圖為細(xì)胞接種了腺病毒疫苗后表面表達(dá)出大量抗原。
展 望
滅活是我們主動(dòng)對(duì)抗病毒的武器,除直接的消殺外,我們還可以利用滅活的病毒為我們自己添加一堵免疫城墻。尋找僅破壞核酸而不改變抗原結(jié)構(gòu)、成本低、通量高、無毒性的滅活方式,是提升滅活病毒疫苗制備工藝的目標(biāo)。目前,多種物理滅活的方法也在疫苗開發(fā)上表現(xiàn)出很大的潛力,甚至有些方面更有優(yōu)勢(shì)。首先,物理滅活不會(huì)引入新的毒性,可以減去制備上去毒的操作;另外,物理滅活具有廣譜性,對(duì)不同種類或能快速變異的病毒適用性更強(qiáng)。此外,物理滅活還有保留較好免疫原性、制備成本低、通量高的研發(fā)潛能。目前已有利用電離輻射進(jìn)行滅活疫苗研發(fā)的例子,如用γ射線滅活的流感病毒[15]、脊髓灰質(zhì)炎病毒[21]等均表現(xiàn)出一定的開發(fā)潛能。
隨著免疫學(xué)理論的不斷累積和多種滅活技術(shù)的不斷成熟,相信在不久的將來,人類在面對(duì)疫情的時(shí)候可以當(dāng)即反應(yīng),既能迅速消殺,也能快速制備疫苗,主動(dòng)反擊,阻止病毒的擴(kuò)散和傳播。
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